O objetivo deste projeto é desenvolver ferramentas de análise de dados avançadas com foco inicial nas áreas de pesquisa e diagnóstico médico. Estas ferramentas serão desenvolvidas em cooperação com instituições de pesquisa que têm necessidade de análise de dados biológicos reais e complexas que serão apoiadas pelo sistema Flux. Desta forma garantimos que o desenvolvimento destas novas funcionalidades será feito de acordo com as necessidades dos usuários finais e que o sistema desenvolvido estará adequado à necessidades reais de laboratórios. Além disto, estes parceiros serão os primeiros usuários do novo sistema e será oferecida a eles uma ferramenta que efetivamente os auxiliará em seus objetivos. As funcionalidades implementadas são de alta complexidade e com um componente tecnológico elevado, necessitando para isto de pessoal qualificado para seu desenvolvimento. As duas principais linhas de desenvolvimento do projeto são:

- Sequenciamento de próxima geração: Sequenciadores de DNA modernos são extremamente eficientes, gerando uma grande quantidade de dados em pouco tempo. Justamente por causa disto, a análise destes dados é complexa e, apesar de existirem ferramentas de apoio, é um processo em grande parte manual e de difícil sistematização. O sistema Flux apoiará esta atividade através de um workflow de gerência dos dados e de um sistema de análise de dados que integrará ferramentas diversas existentes e incorporará novas ferramentas para permitir um sequenciamento mais eficiente e rápido. Esperamos poder aplicar, em conjunto com nossos parceiros, esta ferramenta no uso de sequenciamento de DNA para fins de diagnóstico médico.

Este trabalho será realizado em conjunto com o Centro de Excelência em Bioinformática da Fundação Oswaldo Cruz, CEBio. O CEBio dispõe dos sequenciadores de próxima geração e de técnicos que os operam. A partir do trabalho realizado hoje por estes técnicos o sistema Flux automatizará o fluxo de sequenciamento não somente armazenando os dados gerados como também automatizando a análise dos mesmos.

- Análise de dados de pacientes de neuromielite óptica: Neuromielite óptica é uma doença semelhante à esclerose múltipla, mas que tem diferenças importantes tanto no diagnóstico quanto no tratamento. Esta doença ainda é pouco estudada e por isto ferramentas de apoio ao diagnóstico e tratamento são importantes. O Centro de Investigação em Esclerose Múltipla da UFMG, CIEM, atende pacientes com a doença, e desta forma dispõe de dados sobre a doença, mas ainda não tem como analisar estes dados de forma eficiente.

Dentro deste projeto propomos o desenvolvimento de um workflow para armazenamento de dados de neuromielite óptica e o desenvolvimento de ferramentas para análise destes dados utilizando algoritmos de mineração de dados e business intelligence. O objetivo destas ferramentas é, contudo, permitir a análise de dados de outras doenças além de neuromielite óptica, e esperamos ao longo do projeto extender a ferramenta para outras doenças, contactando novos parceiros, inicialmente entre os pesquisadores da UFMG e posteriormente em outras instituições.